ぐぐっても思ったより情報が少ないですね。
TWAIN.Netを見つけたので、これをあれこれ触ってみて、とりあえず何とかスキャナから画像を得られるようになりました。
コードを整理したらまた紹介します。

TWAIN以外にも、WIA (Windows Image Acquisition)という技術もあるようなのですが、サポート状況がいまいちとか言う情報もあり、これについてもプログラミング的な情報も少ないですね。
最近、スキャナも一般的なのでもうちょっと色々使われているのかと思いましたが、直接制御するとか言うのはやはり業務用途が多いんでしょうかね。

追記(2011/05/02)

.netでTWAINスキャナから画像の取込(実践編)が書けました。

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